Modernisering og standardisering

Modernisering af prøveflowet sikrer sporbarhed i SSI's WGS- og PCR/RT-PCR-laboratorieprocesser. Anvendte protokoller vil blive digitaliseret og delt offentligt. Dette arbejde vil muliggøre akkreditering på institutionelt niveau og standardisering på nationalt niveau. Derudover vil der etableres et kvalitetspanel af udvalgte patogene mikroorganismer som gøres tilgængeligt for alle danske afdelinger for klinisk mikrobiologi for at fremme og sammenlignelige kapaciteter på nationalt niveau.

Udbyttet vil derfor være:

1. Modernisering og standardisering af protokolstruktur og afprøve brugen af en åben platform til opbevaring og vedligeholdelse af protokoller (protocols.io)
2. Implementering af et WGS LIMS-system til automatisk håndtering af WGS-prøver fra modtagelse i sekventeringsenheden på SSI til sekventering, kvalitetskontrol og levering af data
3. Udvikling af et standardiseret testpanel af patogene mikroorganismer, der kan køres rutinemæssigt til kvalitetssikring